MultiGeneBlast

Описание

MultiGeneBlast е инструмент с отворен код, базиран на преформатиране на FASTA заглавките на белтъчните записи на NCBI GenBank, с помощта на които може да проследи техния изходен нуклеотид и координати. MultiGeneBlast може да помогне при откриването на такива мултигенни части за проекти по синтетична биология. Синтетична библиотека от оперони може да бъде създадена въз основа на нейния изход, за да идентифицира тези оперони, чиято функция е най-близка до желаната от потребителя. Този инструмент предоставя възможности за идентифициране на всички хомоложни геномни региони чрез комбиниране на резултатите от единични BlastP изпълнения на всеки ген и сортиране на геномни региони от всеки запис в GenBank по броя на хитовете, запазването на синтенията и кумулативния битов резултат на Blast. Могат да се извършват търсения в архитектурата, за да се намерят геномни региони с Blast удари към всяка зададена от потребителя комбинация от аминокиселинни последователности.