MD simulation for iPhone

Описание

Университет на Улсан, Факултет по машинно инженерство, лаборатория MNTF (Микро/наномащабно инженерство на термофлуиди). http://home2.ulsan.ac.kr/user/nanofluid/Моля, следвайте уроците по-долу за няколко примерни случая. Всички примери по-долу приемат първоначалните състояния след екрана за зареждане. (регулирайте Dt, за да видите резултата по-бързо. Опитайте също тези с [WCA] и [Ideal]) 1. Симулация на потока на Couette [Старт] - изчакайте, докато системата достигне до равновесие - [Couette] - изчакайте, докато системата достигне до стационарно състояние (профилите на мигновената скорост са налични в сивото поле в дясно-долу) 2. Симулация на потока на Поазей [Старт] - изчакайте, докато системата достигне равновесие - [Поазей] - изчакайте, докато системата достигне стабилно състояние 3. Дифузия симулация [Init3,4,5] - задайте целева температура около 250~350K - [начало] 4. Симулация на замразяване и кристализация [Init3,4,5] - задайте целева температура по-ниска от 80K - [начало] 5. Още съвети! Бутонът [Старт] задава разпределението на скоростта на Максуел-Болцман за всяка молекула течност. ! [L-J] е за VDW потенциал, базиран на молекулярния параметър на аргон, [WCA] е чисто отблъскващо междумолекулно взаимодействие и [Ideal] пренебрегва размера на молекулите и сблъсъците, както предполага законът за идеалния газ. ! Можете да увеличите времевата стъпка (Dt), за да направите симулациите по-бързи, но това може да доведе до прекъсване на симулациите и нулиране. ! Когато симулацията се нулира, целевата температура и времевата стъпка (Dt) се задават на най-ниската възможна стойност. ! Можете да промените целевата температура по време на симулациите и да коригирате текущата температура с помощта на термостат. ! Можете да стартирате симулации в различни начални условия, като използвате бутона [Init]! Бутонът [T/Tt] настройва термостата към системата с целевата температура. „ЧЕРВЕН“ етикет означава термостат за мащабиране на скоростта, а „ОРАНЖЕВ“ етикет означава термостат Nose-Hoover. ***Молекулярна динамика в аргонова течност на iPhone в 5nm канал През последните две десетилетия революционният напредък на високопроизводителните изчислителни ресурси доведе до изследванията на молекулярната динамика (MD) за моделиране на атомистично ниво в персонални настолни компютри. Сега разширявам MD платформите към наличните мощни мобилни компютърни устройства (iPhone) и това може да е първият опит в историята на MD. Флуидни потоци в микронни и наномащабни области често се срещат в компонентите на микро електромеханични системи, микрофлуидни устройства и в компютърни твърди дискове. Например, за системите с твърд диск разстоянието между главата и носителя е от порядъка на десетки нанометри. Потокът на течности в такива малки мащаби не може да бъде описан с помощта на хипотезата за континуума. Молекулярната динамика потенциално може да се справи с тези проблеми, като интерфейси/взаимодействия между твърдо вещество и течност, възникващи в наномащабния режим. Освен това, широкомащабни симулации, базирани на атомистични модели, могат също да адресират прехода от подходи на атомистичен към непрекъснат мащаб. Това е код за молекулярна динамика (MD) (i2DMD), работещ на iPhone. Този код има повечето функции (но опростен за визуализация и образователни цели) на действителния MD код, използван за моите публикации в SCI списания, изброени в информационната връзка. Можете да симулирате поток на Couette, поток на Poiseuille, дифузия и замръзване на аргон в 5nm канал с периодични гранични условия. Надявам се този примерен код да помогне на хората да разберат наномащабната молекула